La crearea logoului Maratonului de la Chişinău s-a pus accentul pe elementele moldoveneşti, pentru a accentua că acesta este maratonul NOSTRU, care trebuie să devină o sărbătoare naţională.
Eroii principali ai logoului sunt locuitorii Moldovei în costume naţionale, amatorii dansului popular, reprezentat frecvent pe covoarele moldovenești. Aflând despre desfăşurarea primului Maratonul Internaţional de la Chişinău, omuleţii au fugit de pe covor, pentru a alerga 42 km 195 metri pe străzile principale ale capitalei moldoveneşti.
Designerul pixelat nu este întâmplător, or covorul este ţesut în stil geometric, care în grafica de calculator s-a transformat în pixeli liniari. Este un stil la modă, care corespunde statutului maratonului – care este practic cel mai important eveniment sportiv din viaţa oricărui oraş.
Şi culorile logoului denotă apartenenţa la Moldova. Ele sunt apropiate de culorile drapelului naţional: albastru, galben şi roşu.
Logoul este creat de către compania Simpals.